鳥海山・飛島ジオパークは、鳥海山の山麓に位置する由利本荘市、にかほ市、遊佐町、酒田市が推進協議会を立ち上げ、それぞれの地域が持つ資源を活かし、県域・市町域といった行政区を越えた広域での連携体制を作っています。

協議会は、ジオパークの運営を担い、幹事会、総会によって意思決定し、決定に基づいて運営しています。また、活動の実行力を担保するために3つの部会を設け活動を展開しています。

鳥海山・飛島ジオパーク 推進協議会事務局